AMORC je považován za strážce nadčasové moudrosti, která byla předávána starými mystickými školami starověkého Egypta a Řecka, arabskými zeměmi a Španělskem. Tak se toto vědění dostalo do Evropy, kde bylo v 17. století poprvé veřejně známo především díky dílu „Fama Fraternitatis“.
Starý a mystický řád Růže a Kříže má pohnutou historii, která je z čistě vnějšího pohledu těžko pochopitelná. Vzhledem k tomu, že často nebyla dána svoboda myšlení, skrýval se řád v průběhu své historie pod různými jmény. Nikdy však nepřestal pokračovat ve svých aktivitách a šířit své učení mezi hledajícími, kteří toužili po světle.
V dnešní době je organizace AMORC strážcem a pokračovatelem v rosekruciánské tradici. Zároveň udržuje stále živé její univerzální kulturní a duchovní dědictví.
Tradice rosekruciánského řádu vypráví, že v době egyptského faraona Amenhotepa IV. (zvaného Achnaton) byly otevřeny mystické školy, aby kromě vyšších kněží a rodiny faraona mohli i další vzdělaní lidé, filosofové, vědci a umělci poznat učení o Bohu, přírodě a člověku.
Do této doby spadají počátky řádu a každý rok v březnu se koná obřad připomínající přirozený začátek roku a otevření mystických škol. Filosofové, mudrci, umělci a vědci ze všech koutů tehdy známého světa cestovali do Egypta, aby se nechali poučit v tradici těchto mystických škol. Po návratu do svých zemí tam otevřeli školy moudrosti a začali šířit učení, provádět iniciace a rituály, aby předali otevřeným a upřímným lidem zvláštní znalosti, které získali v Egyptě.
Vnější souvislá historie rosekruciánství se téměř nedochovala a není přístupná široké veřejnosti. Teprve od vydání historických rosekruciánských rukopisů v 17. století lze do určité míry vysledovat vnější historii.
Od té doby existovaly různé skupiny rosekruciánů, které však dlouho nevydržely, protože se začaly příliš orientovat na materiální věci, což není v souladu s duchem řádu. I dnes existuje řada společností rosekruciánů; některé mají dokonce tento pojem ve svém názvu. Existuje však pouze jeden autentický rosekruciánský iniciační řád, který zachovává původní a univerzální učení a zpřístupňuje je všem vážně hledajícím, a to Starý Mystický Řád Růže a Kříže, AMORC.
Na konci 19. století se tehdejší řád rosekruciánů v Evropě rozhodl uchovat učení řádu v bezpečí v zemi, která se nachází na jiném kontinentu. Ve staré Evropě se předvídalo zničení a zpustošení celých částí zemí, což mohlo vést k dlouhodobému zapomenutí učení řádu.
Bylo nutné najít řešení. Nejvyšší rada řádu se rozhodla sestavit souhrn učení a přenést jej do země, která podle všech předpokladů nebude v příštích sto letech postižena revolučními nepokoji a válečnými zkázami.
Na počátku 20. století byly proto vybrány Spojené státy americké, aby uchovaly podstatu učení. Do New Yorku byly zaslány balíky s rukopisy, knihami a dalším výukovým materiálem z mnoha evropských center rosekruciánů: z Petrohradu, Moskvy, Berlína, Hamburku, Vídně, Frankfurtu, Lipska, Ženevy, Prahy, Paříže, Lyonu, Londýna, Edinburghu a Florencie.
Učení Ordo Rosae Crucis bylo poté uchováno a udržováno při životě v USA. Teprve po skončení druhé světové války se vztahy s Evropou opět zintenzivnily a postupně vznikaly Velké lóže v mnoha zemích, i mimo Evropu. Odkazy na současné jazykové jurisdikce najdete na www.amorc.org.
Jurisdikce českého a slovenského jazyka vznikla v roce 1990 a má sídlo v Praze.